Die „Würzburger Diözesangeschichtsblätter" widmen sich als Zeitschrift, dem Vereinszweck entsprechend, der Bistumsgeschichte in ihrer ganzen zeitlichen Erstreckung und thematischen Vielfalt. Durch umfassende Abhandlungen, kürzere Aufsätze zu Spezialfragen und Buchbesprechungen sollen neue Erkenntnisse vermittelt und der Bezug zur allgemeinen wissenschaftlichen Forschung gewahrt werden.
In den „Quellen und Forschungen zur Geschichte des Bistums und Hochstifts Würzburg" werden in monographischer Form zum einen grundlegende Quellen zur Bistumsgeschichte ediert, zum anderen größere Studien, Dissertationen und Aufsatzsammlungen veröffentlicht.
